title-s"> EMDB-China正式升级为EMDB/EMPIAR-China网站

发布时间:2019-01-10

  EMDB-China(http://www.emdb-china.org.cn)网站自2018年8月发布以来,已稳定运行5个月,网站点击量累计近万次。为进一步完善EMDB-China网站的数据服务功能、提升用户体验,自2019年1月起EMDB-China网站正式升级为EMDB/EMPIAR-China网站。该网站在对EMDB网站数据作镜像的同时,新增了EMPIAR网站数据的镜像,为方法学研究提供了大量的测试数据集,同时该部分数据集也可以用来做练习。

  

图1. EMDB/EMPIAR-China网站

  本次网站在服务功能方面的升级主要体现在EMDB/EMPIAR-China网站数据更新周期、EMPIAR数据页面展示和EMDB数据远程可视化工具升级三方面:

  1、EMDB/EMPIAR-China网站数据更新周期

  数据更新包括两部分内容,一是EMDB/EMPIAR-China FTP与EBI-EMDB/EMPIAR之间每周三的自动同步,均以FTP显示时间为准,EMDB数据同步约需4小时,EMPIAR因数据量较大,完成同步需3-4天;二是网站中EMDB/EMPIAR-China的显示数据更新,以网站last updated日期为准,EMDB-China显示数据每周三当天更新,而EMPIAR同步周期较长,为保证网站更新时间的一致性,EMPIAR-China显示数据滞后1周,即下一个周三更新。

  2、EMPIAR数据页面展示

  EMPIAR数据页面相关功能包括:新增EMPAIR数据页面、EMPIAR数据的搜索、浏览、release date数据排序查看,以及与EMDB-China数据之间的关联查询等。

  

图2. 新增EMPIAR-China数据页面展示

  3、EMDB数据远程可视化工具升级

  新版EMDB数据远程可视化工具提供基于Web的在线EMDB数据预览查看及三维交互,支持Chrome、Firefox、Safari等一系列主流浏览器,使用过程中无需另行安装插件或其它运行环境。新版工具在原有可视化工具基础上对可视化效果进行了改进,通过等值面结合颜色映射的方法更好地展现了EM数据内部形态;加入了新的数据减量传输策略,大幅降低了网络通讯量及数据下载时间;并采用渐近式可视化方法加快了页面响应速度,提升了用户交互体验。

  

图3. 远程数据可视化交互页面

  为了给用户提供更好的访问体验、完善更多功能,在中国科生物物理研究所与中国科计算机网络信息中心合作下EMDB/EMPAIR-China功能开发一直在紧锣密鼓的推进中,目前该项目运行良好,未来将有更多数据校验、数据提交等功能上线,敬请期待。

 

  (供稿:中国科生物物理研究所蛋白质科学研究平台生物成像中心;中国科计算机网络信息中心

 


附件下载:

    百度 搜狗 360搜索 沈逸:中国反击美加税超特朗普预期 未来月球上能打电话盖房子?探月工程总设计师回应 亚美尼亚总统签署法律 允许该国加入欧盟 专家:特朗普的"对等关税" 为世界提供一个难得的机会 丁真不辛苦干活吃不上好吃的饭

        <code id='a04e4'></code><style id='b3223'></style>
      • <acronym id='73072'></acronym>
        <center id='ac902'><center id='268f3'><tfoot id='f1a49'></tfoot></center><abbr id='17b98'><dir id='79bb6'><tfoot id='0aa46'></tfoot><noframes id='b194c'>

      • <optgroup id='50986'><strike id='2b790'><sup id='b6aad'></sup></strike><code id='46893'></code></optgroup>
          1. <b id='f57b3'><label id='6b52a'><select id='19c93'><dt id='1a9bf'><span id='8d32a'></span></dt></select></label></b><u id='ae1f4'></u>
            <i id='c812e'><strike id='e3113'><tt id='a7bae'><pre id='78c5d'></pre></tt></strike></i>